Human Proteome Project (HPP) var hleypt af stokkunum árið 2010 eftir vel lokið Human Genome Project (HGP) til að bera kennsl á, einkenna og kortleggja manna prótein (allt sett af próteinum sem tjáð er af manna erfðamengi). Á tíu ára afmæli sínu hefur HPP gefið út fyrsta stranga teikninguna sem nær yfir 90.4% af manna Próteinmengi. Sem kóða lífsins hefur þessi áfangi mjög mikilvæg áhrif á manna heilsu og meðferð.
Lokið í 2003, Human Genome Project (HGP) var alþjóðlegt samstarf sem stofnað var árið 1990 með það að markmiði að bera kennsl á heildarhóp manna genum og til að ákvarða heildar röð DNA basa í manna erfðamengi. Þann 15. janúar 2001 hafði HGP gefið út fyrstu röð og greiningu á manna erfðamengi. Að bera kennsl á, einkenna og kortleggja manna prótein (allt viðbót próteina sem er kóðað af erfðamenginu) var næsta rökrétta skrefið. Þess vegna, Human Proteome Organization (HUPO) var stofnað 9. febrúar 2001 til að efla próteinfræðirannsóknir. Þann 23. september 2010 var HUPO formlega hleypt af stokkunum Human Proteome Project (HPP) með það að markmiði að útbúa teikningu af manna Próteinmengi (1).
Greiningin á manna erfðamengi spáir fyrir um 20,300 próteinkóða genum. Allt safn próteina sem er kóðað af þessum genum myndamanna Próteinmengi'. Human prótein er miklu stærra en „erfðamengi mannsins“ vegna þess að eitt gen getur verið tjáð í ýmsum formum (próteóformum) vegna efnafræðilegra breytinga við og eftir þýðingu. Talið er að milljón próteinforma geti verið samhliða einum einstaklingi. Árið 2010, við upphaf HPP, fundust varla 70% af próteinum sem spáð var fyrir með erfðamengigreiningu. Dagskrá próteómaverkefnisins var að fylla þessa þekkingarskarð. Með framförum í tækni hefur orðið mögulegt að greina og mæla prótein og form þeirra með meiri nákvæmni. Samt vantar töluvert af próteinum (prótein spáð fyrir um af erfðamengigreiningunni, en enn ógreint) (2,3). Verkefnið er enn í vinnslu; þó er áfangi náð.
Þann 16. október 2020, á tíu ára afmæli sínu, gaf HPP út fyrstu ströngu teikninguna sem nær yfir 90.4% af próteómi mannsins. (1). Þetta bætir umtalsvert þekkingu okkar á líffræði mannsins og skilning á sameindaháttum á frumu- og sameindastigi, sérstaklega hlutverki mannlegs próteóms sem leiðir beint til rannsókna og þróunar á greiningu og meðferðum fyrir krabbamein, hjarta- og æðasjúkdóma og smitsjúkdóma, sérstaklega fyrir persónulega og nákvæmni lyf (4).
Þróun Human Prótein Atlas sýnir mjög mikilvægar framfarir fyrir frekari rannsóknir á sviði greiningar og meðferðar á mönnum (5,6).
***
Tilvísanir:
- HUPO 2021. Proteomics tímalína. Í boði á https://hupo.org/Proteomics-Timeline.
- neXtProt 2021. Prótein mannsins. Fæst á netinu á https://www.nextprot.org/about/human-proteome Skoðað 30. desember 2020.
- Inserm, 2020. Proteomics: lífskóði þýddur um meira en 90%. Sent 07. desember 2020. Aðgengilegt á netinu á https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Skoðað 30. desember 2020.
- Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW o.fl. 2020. Háþröng teikning af próteómi mannsins. Birt: 16. október 2020. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
- Digre A., og Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Spatial localization of the human proteome in health and disease. Protein Science Volume 30, Issue 1. Fyrst birt: 04. nóvember 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987
- The Human Protein Atlas 2020. Human Protein Atlas Fáanlegt á netinu á https://www.proteinatlas.org/about Skoðað 30. desember 2020.
***
