Advertisement

Afbrigði af Coronavirus: Það sem við vitum hingað til

Coronavirus eru RNA veirur tilheyra Coronaviridae fjölskyldunni. Þessar veirur sýna ótrúlega hátt hlutfall villna við afritun vegna skorts á prófarkalestri núkleasavirkni pólýmerasa þeirra. Í öðrum lífverum eru afritunarvillurnar leiðréttar en kransæðaveirurnar skortir þessa getu. Fyrir vikið eru afritunarvillur í kransæðaveirum óleiðréttar og safnast upp sem aftur virka sem uppspretta breytileika og aðlögunar í þessum veirur. Þannig hefur það alltaf verið eðli hlutarins að kórónuveirurnar gengist undir stökkbreytingu í erfðamengi sínu á mjög miklum hraða; meira sendingin, fleiri afritunarvillur gerast og þar af leiðandi fleiri stökkbreytingar í erfðamenginu sem leiða til fleiri afbrigði þar af leiðandi. 

Augljóslega að breytast í nýtt afbrigði er ekki ný af nálinni kórónuveirur. Mannleg kórónuveirur hafa verið að byggja upp stökkbreytingar í ný form í nýlegri sögu. Það voru nokkrir afbrigði ábyrgð á ýmsum farsóttum síðan 1966, þegar fyrsti þátturinn var tekinn upp.  

SARS-CoV var fyrsta banvæna afbrigðið sem olli kransæðavírus faraldur í Guangdong héraði í Kína árið 2002. MERS-CoV var næsta mikilvæga afbrigðið sem olli faraldri í Sádi-Arabíu árið 2012.  

Skáldsagan kransæðavírus SARS-CoV-2, afbrigðið sem ber ábyrgð á núverandi COVID-19 heimsfaraldri sem hófst í desember 2019 í Wuhan í Kína og dreifðist í kjölfarið um allan heim til að verða sá fyrsti kransæðavírus heimsfaraldurs í mannkynssögunni, hefur stöðugt gengið í gegnum frekari aðlögun og safnast fyrir stökkbreytingar á mismunandi landfræðilegum svæðum sem hafa valdið nokkrum undir-afbrigði. Þessir undir-afbrigði hafa minniháttar mun á erfðamengi sínu og gaddapróteinum og sýna mun á smithraða þeirra, meinvirkni og ónæmissýkingu.  

Byggt á ógninni sem af þessum undirafbrigðum stafar eru þau flokkuð í þrjá flokka - Afbrigði áhyggjuefni (VOC), Variants of interest eða Variants in research (VOI) og afbrigði í eftirliti. Þessi flokkur undirafbrigða er byggður á sönnunargögnum sem tengjast smithæfni, ónæmi og alvarleika sýkingar.    

  1. Variants of concern (VOC) 

Áhyggjuafbrigðin (VOC) hafa skýr tengsl við aukningu á smithæfni eða meinvirkni eða minnkun á virkni hvers kyns lýðheilsuráðstafana eins og virkni bóluefna sem eru í notkun. 

WHO merki Ættir  Land sem fannst fyrst (samfélag) Ár og mánuður fundust fyrst 
Alpha F.1.1.7 Bretland September 2020 
Beta F.1.351 Suður-Afríka September 2020 
Gamma P.1 Brasilía desember 2020 
delta F.1.617.2 Indland desember 2020 
  1. Afbrigði af áhuga eða afbrigði í rannsókn (VOI) 

Vitað er að afbrigðin af áhuga eða afbrigðum sem eru til rannsóknar (VOI) hafa erfðafræðilegar breytingar sem geta haft áhrif á smit þeirra, meinvirkni eða virkni lýðheilsuráðstafana og eru auðkennd til að valda verulegum smiti í samfélaginu.

WHO merki Ættir  Land sem fannst fyrst (samfélag) Ár og mánuður fundust fyrst 
eta F.1.525 Nígería desember 2020 
Iota F.1.526   USA  nóvember 2020 
Kappa F.1.617.1 Indland desember 2020 
Lambda C.37 Peru desember 2020 
  1. Afbrigði í eftirliti  

Afbrigði sem eru í vöktun eru greind sem merki og vísbendingar eru um að þau geti haft eiginleika svipaða og VOC en sönnunargögnin geta verið veik. Þess vegna er stöðugt fylgst með þessum afbrigðum fyrir allar breytingar.  

WHO merki Ættir  Land sem fannst fyrst (samfélag) Ár og mánuður fundust fyrst 
 F.1.617.3 Indland febrúar 2021 
 A.23.1+E484K Bretland desember 2020 
Lambda C.37 Peru desember 2020 
 B.1.351+P384L Suður-Afríka desember 2020 
 B.1.1.7+L452R Bretland janúar 2021 
 B.1.1.7+S494P Bretland janúar 2021 
 C.36+L452R Egyptaland desember 2020 
 AT.1 Rússland janúar 2021 
Iota F.1.526 USA desember 2020 
Zeta P.2 Brasilía janúar 2021 
 AV.1 Bretland mars 2021 
 P.1+P681H Ítalía febrúar 2021 
 B.1.671.2 + K417N Bretland júní 2021 

Þessi flokkun er kraftmikil sem þýðir að undirafbrigðin geta verið fjarlægð úr einum hópi eða tekin með í hvaða hóp sem er, allt eftir breytingu á mati á ógnum með tilliti til smits, ónæmis og alvarleika sýkinga.  

Það er kaldhæðnislegt að þróun SAR-CoV-2 virðist vera í gangi núna. Fer eftir eðli þessa veira, svo lengi sem smit er meðal manna verða afritunarvillur og stökkbreytingar. Einhver stökkbrigði eða afbrigði geta sigrast á valþrýstingnum til að verða smitandi og illvígari eða sleppa við ónæmissvörun til að gera bóluefnið minna áhrifaríkt. Hugsanlega munu mun fleiri afbrigði greinast þegar fram líða stundir á þeim svæðum sem eru með meiri smit. Að lágmarka sendingu og stöðugt eftirlit eru lykillinn að innilokunaraðferðum.  

***

Heimildir:  

  1. Prasad U., 2021. Nýir stofnar af SARS-CoV-2 (the veira ábyrgur fyrir COVID-19): Gæti nálgun „hlutleysandi mótefna“ verið svar við hraðri stökkbreytingu? Vísindaleg Evrópu. Birt 23. desember 2020. Aðgengilegt á netinu á http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/  
  1. WHO, 2021. Rekja SARS-CoV-2 afbrigði. Fæst á netinu á https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 
  1. ECDPC 2021. SARS-CoV-2 afbrigði af áhyggjum frá og með 8. júlí 2021. Aðgengileg á netinu á https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern 

***

Umesh Prasad
Umesh Prasad
Vísindablaðamaður | Stofnandi ritstjóri Scientific European tímarits

Gerast áskrifandi að fréttabréfinu okkar

Til að uppfæra með öllum nýjustu fréttum, tilboðum og sérstökum tilkynningum.

Vinsælast Greinar

Vonandi valkostur við sýklalyf til að meðhöndla þvagfærasýkingar

Vísindamenn hafa greint frá nýrri leið til að meðhöndla þvag...

Nanóvélmenni sem bera eiturlyf beint í augun

Í fyrsta skipti hafa verið hannaðir nanóvélmenni sem...

Nothæft tæki hefur samskipti við líffræðileg kerfi til að stjórna tjáningu gena 

Wearable tæki hafa orðið algeng og eru sífellt að fá...
- Advertisement -
94,467Fanseins
47,679FylgjendurFylgdu
1,772FylgjendurFylgdu
30ÁskrifendurGerast áskrifandi