Þýlacínútrýmingarverkefnið sem tilkynnt var um árið 2022 hefur náð nýjum áföngum í framleiðslu á hágæða fornu erfðamengi, breytinga á erfðamengi pokadýra og nýrri tækni við æxlun (ART) fyrir pokadýr. Þessir afara frammeNts munu ekki aðeins styðja við upprisu Tasmaníutígrisdýra (sem hafa verið útdauð síðan 1936 vegna eyðingar manna) heldur munu þeir einnig hjálpa til við að varðveita tegundir sem eru í útrýmingarhættu. Upprisa og endurkoma thylacines aftur inn í upprunalegu Tasmaníu mun endurheimta heilbrigða starfsemi staðbundins vistkerfis. Nýfengin hæfileiki mun einnig hjálpa til við að varðveita tegundir í bráðri útrýmingarhættu.
Nýlega endurgerða erfðamengi þýlacíns, sem er um 3 milljarðar basa að lengd, er fullkomnasta og samliggjandi forna erfðamengi allra tegunda til þessa. Það er sett saman að litningastigi og er talið vera >99.9% nákvæmt. Það felur í sér endurtekna eiginleika sem erfitt er að setja saman eins og centromeres og telomeres, sem erfitt er að endurgera jafnvel fyrir lifandi tegundir. Erfðamengið hefur aðeins 45 eyður, sem verður lokað með frekari raðgreiningaraðgerðum á næstu mánuðum.
Flest forn eintök halda aðeins stuttum DNA röðum með lítið sem ekkert RNA, vegna niðurbrots eftir dauða lífveru. Nýja thylacín erfðamengið er einstakt í óvenjulegri varðveislu langra DNA raða og RNA. RNA brotnar mjög hratt niður og því er varðveisla RNA sjaldgæf í sögulegum sýnum. Í þessu tilviki tókst rannsóknarhópnum að einangra langar RNA sameindir úr varðveittum mjúkvef úr 110 ára gömlu sýni. Þetta er mikilvægt vegna þess að tjáning RNA er breytileg í vefjum, þess vegna gefur nærvera RNA í vefjum hugmynd um virk gen sem þarf til að vefir virki rétt. Nýja RNA lagið gerir erfðamengi þýlacíns sem byggt er upp úr DNA mun gagnlegra við útrýmingu.
Eftir endurgerð thylacine erfðamengisins var næsta rökrétta skrefið að bera kennsl á gen sem liggja að baki kjarna þýlacíneiginleika sérstakrar kjálka- og höfuðkúpugerð. Til að ákvarða þetta bar rannsóknarteymið saman erfðamengi frá þýlacínum við erfðamengi frá úlfum og hundum með svipuð höfuðkúpulaga lögun og auðkennd svæði erfðamengisins sem kallast „Thylacine Wolf Accelerated Regions“ (TWARs) sem síðar reyndust knýja fram þróun höfuðkúpulögunar hjá spendýrum. .
Eftir staðfestingu á því að TWARs séu ábyrgir fyrir höfuðbeinaformgerð, gerði rannsóknarteymið sömu erfðabreytingar sem eru yfir 300 í frumulínu af fituhala dunnart, sem er næst lifandi ættingi þýlacíns og á að vera framtíðarstaðgöngumaður þýlacínfósturvísa.
Næst er þróun á tækni til æxlunar (ART) fyrir dunnart tegundina sem verður staðgöngutýlacín. Áður en týlasínútrýmingarverkefnið hófst var nánast engin ART fyrir pokadýr. Rannsóknin hefur nú þróað mikilvæga tækni til að framkalla stýrt egglos á mörgum eggjum samtímis í dunnart. Hægt er að nota eggin til að búa til ný fósturvísa til að hýsa breytt týlasín erfðamengi. Rannsakendur gátu einnig tekið frjóvgað einfrumu fósturvísa og ræktað þá hálfa leið á meðgöngu í gervi legi. Hægt er að beita nýju ART-möguleikunum yfir pokadýrafjölskylduna til að útrýma þýlacíni sem og til að bæta ræktunargetu pokadýra í útrýmingarhættu.
Upprisa og endurkoma thylacines aftur inn í upprunalegu Tasmaníu mun endurheimta heilbrigða starfsemi staðbundins vistkerfis. Nýfengin hæfileiki mun einnig hjálpa til við að varðveita tegundir í bráðri útrýmingarhættu.
***
Tilvísanir:
- Háskólinn í Melbourne 2024. Fréttir – Nýir áfangar hjálpa til við að knýja fram lausnir á útrýmingarvanda. Sent 17. október 2024. Fæst á https://www.unimelb.edu.au/newsroom/news/2024/october/new-milestones-help-drive-solutions-to-extinction-crisis
- Thylacine Integrated Genomic Restoration Research Lab (TIGRR Lab) https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/the-thylacine/ og https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/research/
- Þýlacín https://colossal.com/thylacine/
***
Tengdar greinar
Útdauð Thylacine (Tasmanískt tígrisdýr) á að rísa upp (18 ágúst 202)
***